肝活检很安全，它是在彩超引导下操作，穿刺的位置、深度都能够准确定位。它只取出肝脏的三百万分之一，约不足1毫米粗细、15毫米长的肝组织，造成的肝脏损伤微不足道。只要患者凝血功能正常，黄疸不太严重，无肝血管瘤及失代偿性肝硬化患者，都可行肝活检。肝脏活检病理可明确肝脏的炎症程度、纤维化程度及乙、丙肝病毒的存在与否，还可根据其形态的特异性改变判断病因，如酒精性肝病等。肝活检适用于各种原因引起的肝损害，尤其对病毒携带者、慢性肝炎、肝内占位及诊断不明的肝损害意义更大。目前，医学界把这项检查作为肝病诊断病因、判定疗效的金标准。

对于慢性肝炎患者，肝活检的目的是明确的，就是确定肝脏目前实际的损害情况，根据病理检查的结果，来确定是否治疗，或治疗的方案。对于那些不典型的状况，就是肝功长期波动，但血清生化检查并不符合抗病毒指征的患者，尤其重要，可以避免滥用抗病毒药物或贻误治疗时机，造成不好的后果。临床的结果表明，炎症的活动度和抗病毒药物的有效率呈正相关，G3以上的患者，应用抗病毒药物，血清转换的比例甚至可以达到80％以上，所以肝活检也是用药最好的诊断和标准。此外，在抗病毒治疗前进行肝活检，和治疗后的情况进行比对，来判断治疗的效果和预后是有很大价值的。

临床应用价值：

　1、用于肝内外疾病的鉴别诊断：肝脾肿大、肝区痛、肝功能异常影像检查，很难与病毒性肝炎区别，此时应进行肝穿刺。症状不多，但黄疸明显，肝脏亦明显肿大，甲胎蛋白检测滴度较高，碱性磷酸酶或转肽酶滴度很高，此时亦应进行肝穿刺明确诊断。
　2、鉴别黄疸的性质和原因：病史、临床实验室检查后仍不能确定黄疸的病因时可以作肝脏活体组织检查。深度黄疸患者作肝穿刺是有危险的，只在观察治疗8周后诊断仍不十分明确时，才考虑作肝脏活体组织检查。
　3、鉴别肝炎的临床类型：慢性肝炎的病理分类，单靠临床难以分清，但它们的预后不一样。慢性活动性肝炎和早期肝硬变的鉴别也很困难，慢性活动性肝炎经适当调治，病变是可逆转的，若肝硬变出现，是难以逆转的。病毒性肝炎而又无明确的实验室指标时，肝穿刺活检能提供明确的病理诊断以指导临床治疗及预后的判断。
　4、作为判断药物治疗效果的指标：药物的疗效不能单凭患者主观感觉，化验检查也受各种技术因素的影响，而肝穿刺提供的肝组织依据比较客观确切。
　5、明确酒精性肝硬化的诊断与分期：其检查结果常具有特征性，而且可发现不可逆性肝纤维化与可逆性炎症的程度。
　6、诊断肝脏肉芽肿病变和其他病变：如肝结核、波浪热、组织胞浆菌病、球孢子菌病、黄疸出血型钩端螺旋体病及肝阿米巴病、立克次氏体病、蠕虫病等。
　7、诊断肝脏有无浸润性病变以及某些代谢性病变，如肝脏肿瘤、肝糖元累积病、肝脏淀粉样变性、单核巨噬系统疾病、肝豆状核变性、血色病等。

组织病理学诊断：

组织病理学诊断包括病因(根据血清或肝组织的肝炎病毒学检测结果确定病因)、病变程度及分级分期结果。将炎症活动度及纤维化程度分别分为1—4级(G)和1—4期(s)

炎症活动程度分级：

慢性肝炎按活动度(G)分为G1——4，可分为轻、中、重三度。
　1、轻度慢性肝炎(包括原慢性迁延性肝炎及轻型慢性活动性肝炎)：G1—2，S0—2。
病理学表现：肝细胞变性,点、灶状坏死或凋亡小体；汇管区有(无)炎症细胞浸润，扩大，有或无局限性碎屑坏死(界面肝炎)；小叶结构完整。
　2、中度慢性肝炎（相当于原中型慢性活动性肝炎）：G3，S1—3。
病理学表现：汇管区炎症明显，伴中度碎屑坏死；小叶内炎症严重，融合坏死或伴少数桥接坏死；纤维间隔形成，小叶结构大部分保存。
　3、重度慢性肝炎(相当于原重型慢性活动性肝炎)：G4，S2—4。
病理学表现：汇管区炎症严重或伴重度碎屑坏死；桥接坏死累及多数小叶；大量纤维间隔，小叶结构紊乱，或形成早期肝硬化。

纤维化分级

指肝内有过多胶原沉积，依其对肝结构破坏范困、程度和对肝微循环影响的大小划分为1—4期(Ｓ１—4)
　1、S1包括汇管区、汇管区周围纤维化和限局窦周纤维化或小叶内纤维瘢痕，两者均不影响小叶的完整性。
　2、S2纤维间隔即桥接纤维化(bridgingfibrosis)，主要由桥接坏死发展而来，S2虽有纤维间隔形成，但小叶结构大部分仍保留。
　3、S3大量纤维间隔，分隔并破坏肝小叶：致小叶结构紊乱，但尚无肝硬化。此期一部分患者可出现门静脉高压和食管静脉曲张。
　4、S4早期肝硬化，肝实质广泛破坏，弥漫性纤维增生，被分隔的旰细胞团呈不同程度的再生及假小叶形成。此期炎症多尚在进行，但与肝硬化尚有区别。